水稻亚种间基因组水平微卫星多态性分析

首页 > 按月查看>2007年第1月 >

水稻亚种间基因组水平微卫星多态性分析
DOI:
                        
作者:
                        
作者单位:
作者简介:
通讯作者:
基金项目:国家自然科学基金;重庆市自然科学基金

Analysis of the whole-genome-wide polymorphisms of microsatellites between two rice subspicies

Author:

Affiliation:

Fund Project:

摘要

图/表

访问统计

参考文献

相似文献

引证文献

资源附件

摘要:

从公布的水稻两个亚种（籼稻9311和粳稻Nipponbare）基因组草图序列中,搜寻了所有的完整微卫星位点,发现单碱基重复中A/T重复占大多数,二碱基重复中AT/TA、GA/TC、AG/CT重复居多,三碱基中GGC/GCC、GCG/CGC、CCG/CGG重复较多。通过相互比较,不同基序和基因区域的微卫星多态性有较大差异：内含子和基因间区中微卫星的多态性较高（分别约为45%和40%）,外显子中的微卫星多为三碱基重复,而且多态性较低（约为25%）;两个亚种具多态性的微卫星间距平均约为12.7 kb和16.4 kb。

Abstract:

All perfect microsatellites in draft genome sequences of two main rice subspecies(indica ssp.9311 and japonica ssp.Nipponbare) were detected in this paper.Most of MNRs are A/T repeats;most of the dinucleotide repeats(DNRs) are AT/TA,GA/TC,AG/CT repeats;mo

参考文献

相似文献

引证文献

引用本文

谭军,徐勤民,周其兴,薛庆中.水稻亚种间基因组水平微卫星多态性分析[J].重庆工商大学学报（自然科学版）,2007,(1):
TAN Jun, XU Qin-min, ZHOU Qi-xing, XUE Qing-zhong. Analysis of the whole-genome-wide polymorphisms of microsatellites between two rice subspicies[J]. Journal of Chongqing Technology and Business University(Natural Science Edition）,2007,(1):

复制

文章指标

点击次数:
下载次数:

历史

收稿日期:
最后修改日期:
录用日期:
在线发布日期:

引用本文

分享

文章指标

历史