| 引用本文: | 谭军,徐勤民,周其兴,薛庆中.水稻亚种间基因组水平微卫星多态性分析(J/M/D/N,J:杂志，M：书，D：论文，N：报纸).期刊名称,2007，（1）： |
| CHEN X. Adap tive slidingmode contr ol for discrete2ti me multi2inputmulti2 out put systems[ J ]. Aut omatica, 2006, 42(6): 4272-435 |
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| 摘要: |
| 从公布的水稻两个亚种（籼稻9311和粳稻Nipponbare）基因组草图序列中,搜寻了所有的完整微卫星位点,发现单碱基重复中A/T重复占大多数,二碱基重复中AT/TA、GA/TC、AG/CT重复居多,三碱基中GGC/GCC、GCG/CGC、CCG/CGG重复较多。通过相互比较,不同基序和基因区域的微卫星多态性有较大差异：内含子和基因间区中微卫星的多态性较高（分别约为45%和40%）,外显子中的微卫星多为三碱基重复,而且多态性较低（约为25%）;两个亚种具多态性的微卫星间距平均约为12.7 kb和16.4 kb。 |
| 关键词: 水稻亚种 基因组 微卫星 多态性 分子进化 |
| DOI： |
| 分类号:S530 |
| 基金项目:国家自然科学基金;重庆市自然科学基金 |
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| Analysis of the whole-genome-wide polymorphisms of microsatellites between two rice subspicies |
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TAN Jun XU Qin-min ZHOU Qi-xing XUE Qing-zhong
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| Abstract: |
| All perfect microsatellites in draft genome sequences of two main rice subspecies(indica ssp.9311 and japonica ssp.Nipponbare) were detected in this paper.Most of MNRs are A/T repeats;most of the dinucleotide repeats(DNRs) are AT/TA,GA/TC,AG/CT repeats;mo |
| Key words: rice subspecies genome microsatellites polymorphisms molecular evolution |
